Nhật Bản là đất nước có rất nhiều bảo tàng với các chủ đề khác nhau, những viện bảo tàng về tôn giáo, lịch sử, nghệ thuật hay thậm chí là ẩm thực. Dưới đây là danh sách những bảo tàng lịch sử nổi tiếng ở Nhật Bản.
1. Bảo tàng quốc gia Tokyo

Bảo tàng quốc gia Tokyo, Nhật Bản
Nằm trong công viên Uneo, bảo tàng quốc gia Tokyo là một trong những bảo tàng lịch sử nổi tiếng ở Nhật Bản. Nơi đây có bộ sưu tập đầy đủ nhất các bảo vật của quốc gia và những tư liệu văn hoá truyền thống của sứ xở hoa anh đào.
2. Bảo tàng Edo – Tokyo

Bên trong bảo tàng Edo – Tokyo
Bảo tàng Edo – Tokyo là nơi để du khách có cái nhìn sống động về quá khứ của Tokyo – chính là Edo trước đây. Khách du lịch có thể nhận thấy nhiều sự khác biệt giữa Edo và Tokyo. Chẳng hạn như phong tục, tập quá, kiến trúc xây dựng, môi trường tự nhiên hay cuộc sống của người dân. Bảo tàng này là nơi rất thú vị để du khách tìm hiểu về thủ đô Tokyo hiện đại trước đây trong chuyến du lịch Nhật Bản.
3. Bảo tàng Shiraoi Ainu

Bảo tàng Shiraoi Ainu được xây dựng ngoài trời ở Hokkaido
Đây là một trong các bảo tàng lịch sử nổi tiếng ở Nhật Bản nói về dân tộc Ainu. Đó là những người dân bản địa ở miền Bắc Nhật Bản. Bảo tàng này được xây dựng ngoài trời, tái hiện lại hình ảnh làng quê truyền thống với các ngôi nhà lợp mái tranh nằm dọc bờ hồ Poroto. Mỗi ngôi nhà sẽ thể hiện những khía cạnh khác nhau trong văn hoá và lối sống của người Ainu.
4. Bảo tàng Sengukan

Bảo tàng Sengukan nằm ở lối vào đền Outer
Bảo tàng Sengukan là nơi để khách du lịch tham quan và tìm hiểu việc xây dựng miếu thờ thần Ise linh thiêng. Được xây dựng vào mùa xuân năm 2012, bên trong bảo tàng có triển lãm 1 bản sao của ngôi đền cũng như các mô hình của khu thờ chính. Sẽ có 1 cuốn sách hướng dẫn bằng tiếng Anh cho khách du lịch tham khảo nhưng tất cả biển chỉ dẫn đều viết bằng tiếng Nhật.